WINE目前实现了Windows体系结构中的Win32子系统，它与Linux系统交互方式如图1所示。Linux结构（如图1右边靠下部分所示）可分为三层：Linux提供的Libc、Libx11等共享库、Linux内核与Linux设备驱动。WINE结构（参见图1右边靠上的部分）中各模块的功能如下：
Windows DLLs：WINE提供的各种Windows动态库，包括WINE内置（由Linux共享库实现）与Windows操作系统原始的动态库，使用原始动态库函数能够保证其与对应的Windows程序的功能需求完全兼容。内置的动态库将替换Windows原始的动态库。
Windows（NT）Core DLLs：包含NTDLL、KERNEL/ KERNEL32、GDI/GDI32、USER/USER32这四个/对DLL。这些DLL均属于Windows的内核文件，其它Windows DLL都建立在这些核心DLL基础上。WINE建立在Linux内核上，没有实现Windows内核，所以这些DLL在WINE中都须要重新实现。
WINE Server：管理WINE启动的各类进程，其功能相当于WINE内核。
WINE executadle：在WINE中可以直接运行的可执行文件。包括DOS、Win16、Win32以及Winelib。Winelib指Windows程序的源码在WINE中编译生成的可执行文件，WINE提供了产生这种执行文件的工具（Winebuild）。
WINE drivers：WINE在Linux内核上建立了一个提供Windows NTDLL与KERN-EL32功能的代理层。这种设计方式决定了Windows程序在Linux中使用驱动必须满足该设备在Linux中被支持或WINE已经实现了Windows驱动的API与Linux驱动接口粘合的代理功能。
